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吉安市特殊教育学校的助学金申请流程一般包括以下几个步骤：首先，学生需要提交助学金的申请及相关证明材料。接着，学校会进行资格审核和评定。审核通过后，学校将名单上报至相关部门。最后，由教育部门或相关机构完成最终审批并划转资金。

发放时间通常在每年的学期初或学期末，确保资金能及时帮助到需要帮助的学生。具体的时间可能会因学校和当地政策的不同而有所差异，建议学生及时关注学校公告以获取最新信息。