吉安市中等专业学校的毕业证书与普通高中毕业证书在效力上并不完全相同。中专毕业证书主要证明学生在某一专业领域接受过中等专业技能教育，而普通高中毕业证书则侧重于基础教育。两者教育的和侧重点不同，因此它们的证书效力也有所差异。在具体应用上，如求职、升学等方面，需要根据具体情况判断其效力。如需了解更多详细信息，建议咨询当地教育部门。