新余市中科职业高级中学对学生违纪行为的处理是非常严肃且重视的。一旦有学生出现违纪行为，学校会先进行了解调查，依据事情的严重程度，给予相应的处罚。这可能包括警告、记过、留校察看，甚至更严重的处分如退学。

同时，学校也会进行教育引导，帮助学生认识到错误的严重性，并引导学生改正错误。学校致力于创造一个良好的学习和生活环境，确保所有学生都能在遵守纪律和规范的前提下健康成长。