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江西省吉安市卫生学校的毕业证书与普通高中毕业证书的效力是不同的。卫生学校的毕业证书是在职业技能教育背景下颁发的，主要强调对学生专业技能的培养。而普通高中毕业证书则代表学生完成了基础教育。两者虽然都是教育阶段的证书，但在教育类型、学习及目的上有所不同，因此其效力也不等同。吉安市卫生学校的毕业证书主要是在卫生医疗领域具备一定的专业认可度。