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新余市中等专业学校的毕业证书与普通高中毕业证书的效力并不完全相同。虽然中专教育也是中等教育的一部分，但中专教育更侧重于职业技能培训，而普通高中则更注重基础学科的学习。因此，中专毕业证书通常证明的是学生在特定职业领域的技能水平，而普通高中毕业证书则是广泛学术知识的证明。两者虽然都是中等教育阶段的证书，但其功能和认可度存在差异。