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江西长江科技中等专业学校的毕业证书与普通高中毕业证书在法律效力上有所不同。中专毕业证更注重职业技能教育，主要面向就业市场，强调实用技能培养。而普通高中毕业证则更偏向于基础教育，为学生打下文化基础，对接高等教育。在社会认可度上，两者可能存在差异。具体情况需结合社会需求和用人单位具体要求而定。因此，两者的同等效力并不是绝对的。